南京水利科学研究院建于1935年，原名中央水工试验所，是我国最早成立的水利研究机构。直属国家水利部、交通部、电力工业部。我国岩土工程学科奠基人、中国科学院院士黄文熙教授在中央水工试验所的基础上于1940年建立了我国第一个土工试验室，岩土工程研究所就是在此基础上，经过七十多年的不懈努力发展起来的。

我所不仅是我国最早开展岩土工程研究的专业科研机构，而且是目前国内最大的岩土工程问题研究实体之一。现有职工80人，其中教授级高工35人、高级工程师28人。拥有大量高新科研设备，如：400gt、50gt、5gt土工离心机、离心机振台、高土石坝模型试验辅助机器人、造波机；大型静动三轴仪、大型流变仪、大型高压渗透仪、超大型三轴仪、大型直剪仪、大型劣化仪；空心圆柱扭剪仪、土体动强度研究设备、VJ-Tech非饱和土三轴仪、CKC多功能三轴仪、X射线衍射仪、扫描电子显微镜、土体特征曲线试验仪、探地雷达、剑桥自钻式旁压仪等。具有多学科研究方向，主要有：岩土力学基本理论与方法、高土石坝筑坝关键技术、软土地基处治新方法、环境岩土工程关键技术、地质和地震灾害成因分析及防治、岩土工程安全监测及除险方法。设有一个岩土工程试验中心：土工试验室、土工合成材料试验室、筑坝材料试验室、离心模型试验室、原观仪器试验室。

研究所长期以来致力于国家公益性建设项目的科学研究，承担了大量国家重点研发计划项目、国家科技攻关项目、国家自然科学基金项目、部重点科研项目等重大科研任务；主持编写国家、部颁标准、规程、规范与条例40余项、出版学术专著35部：先后获国家级、部省级科技进步奖获90余项、国家专利40项 ,设有“岩土工程”博士点和“水利水电工程”、“岩土工程”、“防震减灾”硕士点，培养了一大批岩土工程专业的博士、硕士。

水利部土石坝破坏机理与防控技术重点实验室、《岩土工程学报》编辑部、中国水利学会岩土力学专业委员会、中国土木工程学会土力学与岩土工程分会土工测试专业委员会、中国水利学会岩土力学专业委员会土工测试专门委员会、中国土木学会港口工程学会塑料排水板专业委员会、水利部南京计量检定中心设在本所。